Les différence principale entre l'électrophorèse sur gel et la SDS PAGE est que L'électrophorèse sur gel est une technique utilisée pour séparer l'ADN, l'ARN et les protéines, tandis que SDS PAGE est un type d'électrophorèse sur gel utilisé principalement pour séparer les protéines. Généralement, SDS PAGE donne une meilleure résolution que l'électrophorèse sur gel classique.

L'électrophorèse sur gel et la SDS PAGE sont des techniques en biotechnologie qui aident à la séparation des macromolécules en fonction de la charge et de la taille. En règle générale, l'électrophorèse sur gel utilise des lamelles de gel d'agarose pour la séparation, tandis que la SDS PAGE utilise des lamelles de gel de polyacrylamide.

Domaines clés couverts

1. Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel - Définition, procédure, importance 2. Qu'est-ce que la PAGE FDS - Définition, procédure, importance 3. Quelles sont les similitudes entre l'électrophorèse sur gel et la PAGE SDS – Aperçu des caractéristiques communes 4. Quelle est la différence entre l'électrophorèse sur gel et la PAGE SDS – Comparaison des principales différences

Termes clés: Agarose, ADN, électrophorèse sur gel, polyacrylamide, protéines, SDS PAGE

Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel

L'électrophorèse sur gel est une technique qui sépare des fragments de macromolécules telles que l'ADN, l'ARN et les protéines en fonction de leur taille et de leur charge. Au cours de l'électrophorèse sur gel, les macromolécules se déplacent sous l'influence d'un champ électrique sur une matrice de gel, qui contient des pores à travers lesquels les macromolécules se déplacent. L'électrophorèse sur gel est la technique générale qui analyse l'ADN à partir de techniques de PCR, RFLP, de clonage, de séquençage d'ADN ou de transfert. Les nanoparticules peuvent également être séparées par électrophorèse sur gel. Le gel stab est préparé à partir d'un polysaccharide appelé agarose dérivé d'algues. Les gels d'agarose sont constitués de molécules d'agarose à longue chaîne reliées entre elles comme une toile d'araignée. La vidéo 1 décrit la préparation d'un gel d'agarose.

L'ADN et l'ARN contiennent tous deux des groupes phosphate à chacun de leurs nucléotides monomères. Par conséquent, ils possèdent une charge négative égale dans toute la molécule. De plus, ils migrent vers l'électrode positive sous le champ électrique. La vitesse de migration dépend de la taille de l'acide nucléique. Les molécules plus courtes migrent plus rapidement à travers les pores tandis que les plus grosses prennent un certain temps.

Figure 1: Bandes d'ADN sur un gel d'agarose

Qu'est-ce que la FDS PAGE

SDS PAGE (électrophorèse sur gel de dodécyl sulfate de sodium-polyacrylamide) est une technique analytique utilisée pour séparer les molécules chargées en fonction de la taille. Dans ce processus, le SDS est utilisé pour isoler les protéines en les dénaturant. Comme le SDS est un détergent; la structure tertiaire des protéines en est perturbée, ramenant la protéine repliée en une molécule linéaire. En outre, il enrobe cette molécule de protéine linéaire d'une charge négative uniforme. SDS PAGE se compose de deux gels avec des concentrations différentes. La couche supérieure est appelée gel d'empilement dans lequel les échantillons sont chargés tandis que la couche inférieure est appelée gel de résolution. La concentration en polyacrylamide du gel d'empilement est de 3,5 à 4 % (grande taille des pores) et il concentre les protéines dans une bande. La concentration de polyacrylamide dans le gel de résolution est de 4 à 20 % (petite taille des pores) et il sépare les protéines en fonction de leur taille. La vidéo 2 montre la préparation d'une PAGE SDS.

SDS PAGE permet une séparation rapide des protéines, facilitant l'analyse ultérieure telle que le Western blot.

Figure 2: Bandes de protéines sur SDS PAGE

Étant donné que le pouvoir de résolution de la SDS PAGE est supérieur à celui d'un gel d'agarose ordinaire, la SDS PAGE aide à séparer les petits fragments d'ADN d'une taille de 5 à 500 pb.

Similitudes entre l'électrophorèse sur gel et la SDS PAGE

Différence entre l'électrophorèse sur gel et la PAGE SDS

Définition

Électrophorèse sur gel: Technique utilisée pour séparer des fragments de macromolécules telles que l'ADN, l'ARN et les protéines en fonction de leur taille et de leur charge

PAGE FDS: Une technique analytique utilisée pour séparer les molécules chargées en fonction de la taille

Composition

Électrophorèse sur gel: Égal sur tout le gel; composé d'agarose

PAGE FDS: Deux gels avec des concentrations différentes; composé de polyacrylamide

Exécuter la configuration

Électrophorèse sur gel: Course horizontale

PAGE FDS: Course verticale

Méthodologie de casting

Électrophorèse sur gel: Se fixe en refroidissant

PAGE FDS: Fixe par une réaction chimique

Taille des pores

Électrophorèse sur gel: La taille des pores n'est pas uniforme; plus la concentration en agarose est élevée, plus la taille des pores est petite

PAGE FDS: La taille des pores est uniforme; le rapport de l'acrylamide au bis-acrylamide détermine la taille des pores

Concentration

Électrophorèse sur gel: 0.5-2%

PAGE FDS: 6-15%

Séparation

Électrophorèse sur gel: 50 à 20 000 pb d'acides nucléiques

PAGE FDS: 5-250 000 Da protéines

Conditions

Électrophorèse sur gel: Généralement exécuté dans des conditions natives

PAGE FDS: Conditions dénaturantes

Préparation

Électrophorèse sur gel: Simple

PAGE FDS: Un processus complexe

coloration

Électrophorèse sur gel: Avec bromure d'éthidium

PAGE FDS: Coloration de Coomassie ou coloration à l'argent

Conclusion

L'électrophorèse sur gel est une technique analytique qui sépare les macromolécules telles que l'ADN, l'ARN et les protéines en fonction de leur taille. SDS PAGE est un type d'électrophorèse sur gel principalement utilisé pour séparer les protéines dans des conditions dénaturantes. SDS PAGE a un pouvoir de résolution plus élevé par rapport à l'électrophorèse sur gel ordinaire. La principale différence entre l'électrophorèse sur gel et la SDS PAGE réside dans le type de macromolécules séparées et leur procédure.

Référence:

1. « Electrophorèse sur gel ». Khan Academy, disponible ici2. « Électrophorèse sur gel de polyacrylamide SDS (SDS-PAGE). » Institut Diamantina, 26 avril 2017, disponible ici

Image de courtoisie:

1. "Gel electrophorèse 2" Von Mnolf - Photo prise à Innsbruck, Autriche (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia 2. "Coomassie3" de Yikrazuul - Travail personnel (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia