Différence principale - VNTR vs STR

L'ADN répétitif est constitué des modèles d'acides nucléiques qui se produisent en plusieurs copies dans tout le génome. Ils constituent la majeure partie de l'ADN nucléaire des eucaryotes. Les répétitions en tandem sont l'un des principaux types d'ADN répétitif qui copient des unités de séquences répétitives adjacentes les unes aux autres, formant un bloc nucléotidique. VNTR (répétitions en tandem à nombre variable) et STR (répétitions en tandem courtes) sont deux types de répétitions en tandem trouvées dans le génome eucaryote. VNTR est un type d'ADN minisatellite alors que STR est un type d'ADN microsatellite. Les différence principale entre VNTR et STR est que l'unité répétitive de VNTR est de 10 à 60 paires de bases alors que l'unité répétitive de STR est de 2 à 6 paires de bases.

Domaines clés couverts

1. Qu'est-ce que VNTR - Définition, caractéristiques, importance 2. Qu'est-ce que la STR - Définition, caractéristiques, importance 3. Quelles sont les similitudes entre VNTR et STR – Aperçu des caractéristiques communes 4. Quelle est la différence entre VNTR et STR – Comparaison des principales différences

Termes clés: génétique médico-légale, microsatellite, minisatellite, unités nucléotidiques répétitives, STR, répétitions en tandem, VNTR

Qu'est-ce que VNTR

VNTR fait référence à un type de répétitions en tandem dans lequel une courte séquence de nucléotides (10 à 60 paires de bases) est répétée un nombre variable de fois dans un locus particulier. Par conséquent, VNTR est également connu sous le nom de minisatellites. Les VNTR sont dispersés dans tous les chromosomes du génome eucaryote. Généralement, le nombre d'unités répétées dans un VNTR varie d'un individu à l'autre. Par conséquent, la longueur du réseau formé par les VNTR varie également entre les individus. Comme le nombre variant de chromosomes est hérité des parents, ils peuvent être utilisés dans l'identification parentale ou personnelle. La variation des VNTR chez six individus est illustrée à la figure 1.

Figure 1: Variation du VNTR chez les individus

Les VNTR sont les premiers types de polymorphismes utilisés dans le profilage ADN pour déterminer les caractéristiques ADN d'une personne en particulier. Ils sont également utilisés comme marqueurs génétiques dans le RFLP (polymorphisme de longueur des fragments de restriction), une technique qui utilise la PCR, l'électrophorèse sur gel et la production de motifs de bande par Southern blot.

Qu'est-ce que la STR

STR fait référence à un type de répétitions en tandem dans lequel une courte séquence de nucléotides (2 à 6 paires de bases) est répétée un nombre variable de fois dans un locus particulier. Les STR sont un type de microsatellites et sont également appelés répétitions de séquences courtes (SSR) en génétique végétale. Les unités répétitives composées d'un seul nucléotide sont appelées polymorphisme à nucléotide unique (SNP). Les STR sont le type le plus courant de polymorphismes génétiques analysés actuellement en génétique médico-légale. Le profilage de l'ADN avec l'utilisation de STR comme marqueurs génétiques est illustré à la figure 2.

Figure 2: Profilage de l'ADN

Des mutations dans certaines des régions STR conduisent à des maladies génétiques telles que le syndrome de l'X fragile et la maladie de Huntington.

Similitudes entre VNTR et STR

Différence entre VNTR et STR

Définition

VNTR: Le VNTR est un type de répétition en tandem dans lequel une courte séquence de nucléotides (10 à 60 paires de bases) est répétée un nombre variable de fois dans un locus particulier.

STR: STR est un type de répétition en tandem dans lequel une courte séquence de nucléotides (2 à 6 paires de bases) est répétée un nombre variable de fois dans un locus particulier.

Nombre de nucléotides répétitifs

VNTR: VNTR se compose de 10-60 paires de bases.

STR: STR se compose de 2 à 6 paires de bases.

Type d'ADN répétitif

VNTR: VNTR est un type d'ADN minisatellite.

STR: STR est un type d'ADN microsatellite.

Nombre de répétitions

VNTR: VNTR se compose de 10 à 1 500 répétitions dans le tableau.

STR: STR se compose de 5-200 répétitions dans le tableau.

Taille du tableau

VNTR: VNTR forme un tableau de 0,5 à 15 kb.

STR: STR forme une matrice de 10-1000 pb.

Complexité du tableau

VNTR: VNTR produit des tableaux hétérogènes.

STR: STR produit des matrices homogènes.

Conclusion

VNTR et STR sont deux types de répétitions en tandem qui forment des réseaux d'unités répétitives adjacentes dans le génome eucaryote. VNTR se compose de relativement longues unités répétitives de nucléotides (10-60 paires de bases). STR se compose de courtes unités répétitives de nucléotides (2-6 pb). La principale différence entre VNTR et STR réside dans la longueur des unités répétitives de chaque type de répétitions en tandem.

Référence:

1. "Répétition en tandem à nombre variable." Sujets ScienceDirect, disponibles ici. 2. «La science de la génétique médico-légale.» CRG – Conseil pour une génétique responsable, disponible ici.

Image de courtoisie:

1. «D1S80Demo» de PaleWhaleGail sur Wikipedia anglais (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia 2. «Stades of Gene Fingerprinting» de Sneptunebear16 - Travail personnel (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia