Les différence principale entre l'ADN B et l'ADN Z est que le L'ADN-B est droitier, tandis que l'ADN-Z est gaucher. De plus, dans l'ADN-B, les bases qui occupent le noyau et le squelette sucre-phosphate se trouvent à la périphérie de l'hélice tandis que, dans l'ADN-Z, le squelette sucre-phosphate forme un motif en zigzag; par conséquent, les bases se produisent au cœur ainsi qu'à la périphérie.

L'ADN-B et l'ADN-Z sont deux des trois conformations de l'ADN présentes dans la nature. De plus, le diamètre de l'ADN-B est de 20, et il contient 10 résidus par tour tandis que le diamètre de l'ADN-Z est de 18, et il contient 12 résidus par tour.

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Qu'est-ce que l'ADN B

L'ADN-B est la conformation la plus courante et la plus prédominante de l'ADN à l'intérieur de la cellule. Cela signifie que l'ADN préfère exister sous forme B dans des conditions physiologiques naturelles, y compris le pH et les concentrations de sel. De plus, la forme B de l'ADN a été décrite pour la première fois par James Watson et Francis Crick. Cependant, l'ADN B prend d'autres conformations dans des conditions changeantes.

Figure 1: Les structures de l'ADN A, B et Z

De plus, les principales caractéristiques de l'ADN-B incluent l'enroulement à droite, le pas de 34 avec 10 unités répétitives par tour, les unités répétitives mononucléotidiques, le diamètre hélicoïdal de 20, etc.

Qu'est-ce que l'ADN Z

L'ADN-Z est une autre conformation de l'ADN avec une structure hélicoïdale gauche et un squelette sucre-phosphate formant un motif en zigzag. De plus, il a été décrit pour la première fois par Andrew Wang et Alexander Rich. L'ADN-Z se forme en réponse à des concentrations élevées de sel. L'ADN-Z joue un rôle dans la régulation de l'expression des gènes car il peut maintenir l'ADN inactif.

Figure 2: L'axe d'hélice de l'ADN A, B et Z

Similitudes entre l'ADN B et l'ADN Z

Différence entre l'ADN B et l'ADN Z

Définition

L'ADN-B fait référence à la forme typique d'ADN à double hélice dans laquelle les chaînes se tordent vers le haut et vers la droite autour de l'avant de l'axe de l'hélice. Mais, l'ADN-Z fait référence à la forme rare d'ADN à double hélice gaucher dans laquelle les chaînes se tordent vers le haut et vers la gauche autour de l'avant de l'axe de l'hélice. En outre, il possède 12 paires de bases dans chaque tour hélicoïdal et une rainure sur la surface externe.

Formation

Sens de l'hélice

Alors que B-DNA est droitier, Z-DNA est gaucher. C'est donc la principale différence entre l'ADN-B et l'ADN-Z.

Grooves Majeurs et Mineurs

En outre, l'ADN-B contient un sillon principal large et profond et un sillon mineur étroit et profond, tandis que l'ADN-Z contient un sillon principal étroit et profond et un sillon mineur large et peu profond.

Les bases et l'épine dorsale

Dans l'ADN-B, les bases occupent le noyau et le squelette sucre-phosphate se produit à la périphérie de l'hélice tandis que dans l'ADN-Z, le squelette sucre-phosphate forme un motif en zigzag et, par conséquent, les bases se trouvent au noyau ainsi que la périphérie.

L'orientation des Résidus de Sucre

En outre, une autre différence entre l'ADN-B et l'ADN-Z est l'orientation des résidus de sucre. Les résidus de sucre dans l'ADN-B ont une orientation changeante alors que les résidus de sucre dans l'ADN-Z ne sont pas modifiés.

Unité de répétition

L'unité répétitive de l'ADN-B est un mononucléotide tandis que l'unité répétitive de l'ADN-Z est un dinucléotide.

Résidus par tour

L'ADN-B contient 10 résidus par tour tandis que l'ADN-Z a 12 résidus par tour.

L'angle de torsion par unité de répétition

En outre, l'angle de torsion par unité de répétition dans l'ADN-B est de 36° tandis que l'angle de torsion par unité de répétition dans l'ADN-Z est de 60°.

Augmentation par résidu

L'élévation par résidu dans l'ADN-B est de 3,4 Â tandis que l'élévation par résidu dans l'ADN-Z est de 3,75 Â.

Pas d'hélice

Le pas d'hélice est également une différence entre l'ADN-B et l'ADN-Z. Le pas d'hélice de l'ADN-B est de 34 tandis que le pas d'hélice de l'ADN-Z est de 45.

L'inclinaison de la paire de bases

L'inclinaison de la paire de bases dans l'ADN-B est de 6° tandis que l'inclinaison d'une paire de bases dans l'ADN-Z est de 7°.

Rotation de l'unité de répétition

De plus, la rotation de l'unité répétitive de l'ADN-B est de 36° tandis que la rotation de l'unité répétitive de l'ADN-Z est de 60°.

Diamètre

Le diamètre de l'ADN-B est de 20 tandis que le diamètre de l'ADN-Z est de 18.

Angle de torsion glycosidique

L'angle de torsion glycosidique est anti pour la désoxyguanosine et la désoxycytidine dans l'ADN-B tandis que l'angle de torsion glycosidique est syn pour la désoxyguanosine et anti pour la désoxycytidine dans l'ADN-Z.

Pucker de sucre

De plus, le sucre plissé est C2' endo pour la désoxyguanosine et C3' endo pour la désoxycytidine dans l'ADN-B tandis que le sucre plissé est C3' endo pour la désoxyguanosine et C2' endo pour la désoxycytidine dans l'ADN-Z.

La distance de P à partir de l'axe

La distance de P par rapport à l'axe est de 9,0 pour le dGpC et le dCpG dans l'ADN-B, tandis que la distance de P par rapport à l'axe est de 8,0 pour le dGpC et de 6,9 ​​pour le dCpG dans l'ADN-Z.

Conclusion

L'ADN-B est la forme courante d'ADN présente dans les cellules. Il est droitier et se compose de bases au cœur et d'un squelette sucre-phosphate dans la structure périphérique. De plus, il contient 10 nucléotides par tour. La largeur de l'hélice d'ADN est de 20. D'autre part, l'ADN-Z est une forme d'ADN gaucher et moins courante, présente à des concentrations élevées de sel. De plus, son squelette sucre-phosphate présente un motif en zigzag. Il contient également 6 dinucléotides par tour. De plus, la largeur de l'ADN-Z est de 18. Par conséquent, la principale différence entre l'ADN-B et l'ADN-Z réside dans la structure hélicoïdale, la géométrie et les dimensions.

Les références:

1. "Z-DNA, une forme d'ADN pour gaucher." Biocyclopédie, disponible ici.

Image de courtoisie:

1. "Dnaconformations" de Mauroesguerroto - Travail personnel (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia 2. "Formule d'ADN B&Z&A" de Lankenau sur Wikipedia anglais - Transféré de en.wikipedia à Commons. (Domaine public) via Commons Wikimedia