Une carte plasmidique correspond aux positions relatives des éléments dans le plasmide. Une carte plasmidique peut être lue en comprenant les caractéristiques du plasmide. Ce sont le nom et la taille du plasmide, les éléments du plasmide, leurs positions relatives et l'orientation du promoteur. L'origine de réplication (ORI), le gène de résistance aux antibiotiques, le site de clonage multiple (MCS), l'insert ou le gène d'intérêt, la région promotrice, le marqueur sélectionnable et le site de liaison à l'amorce sont les éléments d'un plasmide. Les positions relatives des éléments dans un plasmide peuvent être déterminées en cartographiant le plasmide. Le processus impliqué dans la cartographie des plasmides est appelé cartographie de restriction.

Domaines clés couverts

1. Qu'est-ce qu'une carte plasmidique - Définition, mappage de restriction 2. Comment lire une carte plasmidique – Caractéristiques d'un Plasmid MapP

Termes clés: éléments, nom et taille du plasmide, orientation du promoteur, carte plasmidique, enzymes de restriction, cartographie de restriction

Qu'est-ce qu'une carte plasmidique

Une carte de plasmide est une représentation graphique d'un plasmide, qui montre les emplacements des principaux points de repère ou éléments du plasmide. Les positions relatives des éléments dans un plasmide peuvent être identifiées par mappage des restrictions. Une carte de restriction est une carte de sites de reconnaissance de restriction dans un plasmide particulier. Par conséquent, il est impliqué dans la digestion du plasmide par des enzymes de restriction. Une carte de restriction est montrée dans la figure 1.

Figure 1: Carte des restrictions

Deux méthodes peuvent être utilisées dans le mappage de restriction:

1. Digestion de restriction

– Digestion de restriction du plasmide avec une ou deux enzymes de restriction

– Cartographie du plasmide en fonction des tailles des fragments résultant du plasmide

2. Séquençage

– Séquençage du plasmide entier

– Identification des éléments du plasmide

Comment lire une carte plasmidique

Figure 2: Carte plasmidique

La lecture d'une carte plasmidique se concentre principalement sur les caractéristiques du plasmide. Elles sont;

1. Le nom et la taille du plasmide

2. Les éléments d'un plasmide –

3. Les positions relatives des éléments dans le plasmide

4. L'orientation du promoteur

Conclusion

Une carte plasmidique peut être lue en comprenant les caractéristiques de la carte plasmidique telles que le nom et la taille du plasmide, le type d'éléments dans le plasmide et leurs positions relatives, et l'orientation du promoteur.

Référence:

1. « Qu'est-ce qu'un plasmide ? » Addgene, Disponible ici.

Image de courtoisie:

1. « Carte PDONR221 » par Nothingserious - Analyser la séquence: pDONR221. Addgene. Récupéré le 24 janvier 2016 (CC0) via Commons Wikimedia 2. «Vecteur de clonage PGEX-3X» Par Magnus Manske - Créé par Magnus Manske (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia