Le séquençage Illumina est une méthode de séquençage de nouvelle génération, également appelée «séquençage par synthèse" méthode. Le séquençage d'Illumina est impliqué dans le traitement de millions de fragments en parallèle. Les quatre étapes de base impliquées dans le flux de travail de séquençage Illumina sont la préparation de la bibliothèque, la génération de clusters, le séquençage et l'analyse des données, qui sont décrites plus en détail dans cet article.

Domaines clés couverts

1. Qu'est-ce que le séquençage Illumina - Définition, faits, avantages 2. Comment fonctionne le séquençage Illumina – Processus de séquençage Illumina: – Préparation de la bibliothèque – Génération de clusters – Séquençage – Analyse des données

Termes clés: génération de clusters, analyse de données, séquençage Illumina, préparation de bibliothèques, séquençage par synthèse

Qu'est-ce que le séquençage Illumina

La technologie de séquençage Illumina ou de séquençage par synthèse (SBS) est la technologie de séquençage de nouvelle génération la plus utilisée au monde. Plus de 90 % des données de séquençage du monde sont générées par le séquençage Illumina. Il a été développé à l'origine par Shankar Balasubramanian et David Klenerman à l'Université de Cambridge. Ils ont fondé une société connue sous le nom de Solexa en 1998. Puis Illumina a acheté Solexa en 2007, améliorant rapidement la technologie d'origine. Par conséquent, la méthode est également appelée Méthode de séquençage Solexa/Illumina. Le principal avantage du séquençage Illumina est qu'il offre un rendement élevé de lectures sans erreur.

Comment fonctionne le séquençage Illumina

Les quatre étapes impliquées dans le séquençage d'Illumina sont décrites ci-dessous.

Étape 1. Préparation de la bibliothèque

Figure 1: Tagmentation et ajout de motifs

Étape 2. Génération de cluster

Figure 2: Cellule d'écoulement

Figure 3: Amplification clonale

Étape 3. Séquençage

Première lecture de la séquence inverse

Figure 4: Séquençage par synthèse

Index 1 Lire

Index 2 Lire

Deuxième lecture de la séquence directe

Étape 4. Analyse des données

La vidéo suivante explique le processus complet de séquençage d'Illumina.

Conclusion

Le séquençage Illumina est une méthode de séquençage de nouvelle génération. Le séquençage d'Illumina est impliqué dans la préparation d'une banque de séquençage avec de longs fragments d'ADN de 200 à 600 paires de bases. Les quatre étapes impliquées dans le séquençage Illumina sont la préparation de la bibliothèque, la génération de clusters, le séquençage et l'analyse des données. Étant donné que le séquençage Illumina donne des lectures de séquences avec une grande précision, il s'agit de la méthode de séquençage la plus utilisée dans le monde.

Référence:

1. «Technologie de séquençage par synthèse (SBS)». Technologie de séquençage | Séquençage par synthèse, disponible ici.

Image de courtoisie:

1. "Préparation du traitement de l'ADN" par DMLapato - Travail personnel (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia 2. "Chaînes oligonucléotidiques dans Flow Cell" Par DMLapato - Travail personnel, (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia 3. " Séquençage par synthèse Terminateurs réversibles "Par Abizar Lakdawalla (discussion) - J'ai créé ce travail entièrement par moi-même (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia 4. "Cluster Generation" Par DMLapato - Travail personnel (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimédia