Les différence principale entre le marqueur sélectionnable et le gène rapporteur est que le le marqueur sélectionnable est utilisé pour distinguer les transformants des non-transformants tandis que le gène rapporteur est utilisé pour mesurer le niveau d'expression du gène transformé. De plus, le gène marqueur sélectionnable a son propre promoteur tandis que l'expression du gène rapporteur est régulée par le promoteur du gène transformé.

Les gènes fabricants et rapporteurs sélectionnables sont deux types de gènes utilisés pour analyser les transformants dans les études qui produisent des organismes transgéniques.

Analyse de l'expression génique, gène d'intérêt, gène rapporteur, marqueur sélectionnable, transformants

Qu'est-ce qu'un marqueur sélectionnable

Le marqueur sélectionnable est un type de gènes marqueurs généralement situés dans le plasmide. Il est transformé dans la cellule hôte à l'aide du plasmide. Les transformants qui contiennent le marqueur sélectionnable peuvent croître dans le milieu sélectionnable correspondant. Mais, les non-transformants, qui manquent du marqueur sélectionnable, ne peuvent pas croître dans ce milieu sélectionnable. Cela signifie que le produit génique du marqueur sélectionnable devient le facteur de sélection pour la survie.

Les trois groupes de marqueurs sélectionnables sont les gènes de résistance aux antibiotiques, les gènes marqueurs des antimétabolites et les gènes de résistance aux herbicides. Les marqueurs sélectionnables les plus largement utilisés sont les gènes de résistance aux antibiotiques. Ainsi, seuls les transformants peuvent croître dans le milieu, qui contient l'antibiotique correspondant.

Marqueur sélectionnable

Figure 1: Rôle des gènes résistants aux antibiotiques dans le clonage moléculaire

Cependant, tous les transformants peuvent ne pas contenir le gène d'intérêt. Certains transformants peuvent n'avoir que le vecteur avec le marqueur sélectionnable. Le séquençage ou l'analyse de l'expression génique ne permet que la détection de recombinants possédant le gène d'intérêt.

Qu'est-ce qu'un gène rapporteur

Le gène rapporteur est un type de gènes marqueurs utilisés pour quantifier l'expression du gène. Ils sont fusionnés à la séquence régulatrice du gène d'intérêt. Outre l'analyse de l'expression du gène d'intérêt, les gènes rapporteurs permettent d'étudier la fonction des éléments régulateurs du gène et l'effet des facteurs de transcription sur l'expression du gène. En outre, les gènes rapporteurs sont essentiels dans l'identification de l'expression génique spécifique d'un tissu ou d'une voie.

Figure 2: Rôle du gène rapporteur

La protéine fluorescente verte (GFP) et la luciférase sont le type le plus courant de gènes rapporteurs. La GFP est une protéine rougeoyante sous la lumière UV. La présence d'autres protéines fluorescentes telles que les protéines fluorescentes rouges et jaunes permet l'identification de différentes protéines dans le même système. La luciférase est une enzyme qui catalyse la production de lumière jaune-verte ou bleue à partir du substrat luciférine.

Similitudes entre le marqueur sélectionnable et le gène rapporteur

Différence entre le marqueur sélectionnable et le gène de rapport

Définition

Le marqueur sélectionnable fait référence à un gène dont l'expression permet d'identifier les cellules qui ont été transformées ou transfectées avec un vecteur contenant le gène marqueur tandis que le gène rapporteur fait référence à un gène utilisé pour "marquer" un autre gène ou séquence d'ADN d'intérêt, tel que un promoteur.

Importance

Le marqueur sélectionnable aide à distinguer les transformants des non-transformants tandis que le gène rapporteur aide à mesurer la quantité d'expression du gène transformé.

Promoteur

Le marqueur sélectionnable a son propre promoteur tandis que le gène rapporteur est régulé sous le promoteur du gène transformé.

Emplacement

Le fabricant sélectionnable peut être dans le plasmide ou dans la construction du gène tandis que le gène rapporteur est entre le promoteur et le gène d'intérêt.

Résultat

Les cellules transformées avec le fabricant sélectionnable peuvent croître dans le milieu sélectionnable mais le non transformant ne peut pas croître car il leur manque le marqueur sélectionnable tandis que la quantité de produit génique dans le gène rapporteur dépend de la quantité de gènes d'intérêt transformés avec succès.

Exemples

Les gènes de résistance aux antibiotiques, les gènes marqueurs des antimétabolites et les gènes de résistance aux herbicides sont les types de marqueurs sélectionnables, tandis que la GFP et la luciférase sont des gènes rapporteurs.

Conclusion

Les marqueurs sélectionnables sont les gènes marqueurs utilisés pour cribler les transformants dans le milieu sélectionnable correspondant tandis que les gènes rapporteurs sont des gènes marqueurs pour mesurer la quantité d'expression. La principale différence entre les gènes marqueurs sélectionnables et les gènes rapporteurs réside dans le type de criblage.

Référence:

1. Jha, Nandkishor. « Gènes marqueurs sélectionnables et gènes rapporteurs ». Discussion de biologie, 16 octobre 2015, disponible ici2. "Reporter Gene Assays." Thermo Fisher Scientific, Thermo Fisher Scientific, disponible ici

Image de courtoisie:

1. «Étapes du clonage moléculaire» d'Alexpicardal97 - Travail personnel (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia 2. «Gène rapporteur» de TransControl sur en.wikipedia (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia