Les différence principale entre RAPD et RFLP est que RAPD est un type de PCR qui amplifie des fragments aléatoires d'ADN dans une grande matrice en utilisant des amorces courtes alors que, dans RFLP, une ou plusieurs enzymes de restriction digèrent l'échantillon d'ADN, produisant des fragments de restriction puis séparés par électrophorèse sur gel. Par conséquent, RADP ne nécessite qu'une petite quantité d'ADN pour le dosage tandis que RFLP nécessite une grande quantité d'ADN. De plus, RAPD est un processus rapide, qui peut détecter 1 à 10 loci tandis que RFLP est un processus plus lent, qui ne peut détecter que 1 à 3 loci. De plus, RAPD est incapable de détecter les variants alléliques tandis que RFLP peut détecter les variants alléliques.

RAPD (random amplified polymorphic DNA) et RFLP (restriction fragment length polymorphism) sont deux techniques de biologie moléculaire pour détecter des marqueurs génétiques, qui sont de courtes séquences d'ADN, exploitant les variations de l'ADN homologue.

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Qu'est-ce que le RAPD

RAPD ou ADN polymorphe amplifié au hasard est une méthode rapide basée sur la PCR pour la détection de la variation de l'ADN. Deux laboratoires (Williams et al., 1990; Welsh et McClelland, 1990) ont développé indépendamment la technique. De plus, RAPD utilise une seule amorce arbitraire pour l'amplification de nombreux produits d'ADN discrets. Les étapes du RAPD sont les suivantes:

1. Extraction d'ADN
2. Amplification par amorces aléatoires
3. Electrophorèse sur gel et visualisation des marqueurs

   

   Figure 1: Diversité de la laitue par marqueurs RAPD

De plus, en résolvant les motifs résultants, un profil d'ADN semi-unique d'un échantillon d'ADN particulier peut être généré. En raison de la moindre spécificité de l'amorce aléatoire utilisée dans l'essai, un nombre comparativement plus élevé de loci peut être amplifié par amorce aléatoire. Cependant, le RAPD est une technique importante pour la cartographie génétique, la génétique des populations, la génétique évolutive moléculaire, la sélection animale et végétale, etc. De plus, il est vital pour les débutants en termes de rapidité, de coût, d'efficacité ainsi que du nombre de marqueurs générés.

Qu'est-ce que le RFLP

RFLP ou polymorphisme de longueur de restriction est une méthode qui exploite la variation de l'ADN homologue. C'est aussi une méthode bien connue pour son pouvoir discriminant. Cependant, étant donné que RFLP est une méthode non basée sur la PCR, elle utilise des enzymes de restriction pour la génération de fragments du génome. De plus, RFLP détecte les variations de longueurs de fragments de restriction entre les individus. Les trois étapes impliquées dans RFLP sont les suivantes:

1. Digestion par restriction de l'ADN
2. Électrophorèse sur gel
3. Southern blot par sondes spécifiques et détection

   

   Figure 2: Détection de variantes alléliques par RFLP

Similitudes entre RAPD et RFLP

Différence entre RAPD et RFLP

Définition

RAPD (random amplified polymorphic DNA) fait référence à une technique basée sur la PCR pour identifier la variation génétique tandis que RFLP (restriction fragment length polymorphism) fait référence à une méthode moléculaire d'analyse génétique, qui permet d'identifier les individus sur la base de modèles uniques de coupure d'enzymes de restriction dans régions spécifiques de l'ADN.

Type de méthode

Méthode

Alors que RAPD implique l'amplification de marqueurs génétiques dans un génome en utilisant des amorces aléatoires, RFLP implique la digestion par restriction de l'ADN génomique.

Quantité d'ADN

De plus, RAPD nécessite une petite quantité d'ADN (10-50 ng) pour l'analyse tandis que RFLP nécessite comparativement une grande quantité d'ADN (2-10 μg).

Spécificité pour les espèces

RAPD utilise des amorces aléatoires universelles pour toutes les espèces tandis que RFLP utilise différentes sondes spécifiques aux espèces.

Efficacité

De plus, RAPD a moins d'étapes et c'est un processus rapide tandis que RFLP a plus d'étapes car c'est un processus lent.

Fiabilité

RAPD est moins fiable tandis que RFLP est plus fiable.

Capacité de détection

Une autre différence entre RAPD et RFLP est que RAPD peut détecter 1 à 10 loci tandis que RFLP ne peut détecter que 1 à 3 loci.

Détection des variantes alléliques

De plus, RAPD est incapable de détecter les variants alléliques tandis que RFLP peut détecter les variants alléliques.

Importance

Le RAPD est une technique importante pour la cartographie génétique, la génétique des populations, la génétique évolutive moléculaire, la sélection animale et végétale, etc. tandis que le RFLP est important dans le génotypage, la médecine légale, les tests de paternité, la détection de modèles de maladies héréditaires et la détection de porteurs de maladies..

Conclusion

RAPD est une technique basée sur la PCR pour détecter les marqueurs génétiques présents dans un génome. De plus, il utilise des amorces aléatoires pour l'amplification de ces marqueurs. Comme RAPD est une technique basée sur la PCR, elle ne nécessite qu'une petite quantité d'ADN. De plus, c'est une méthode rapide mais, elle est incapable de détecter les variantes alléliques. En revanche, RFLP est une méthode non basée sur la PCR qui détecte la variation de l'ADN au sein d'un génome. Cependant, il utilise la digestion par restriction de l'ADN, le Southern blot et la détection de séquences à l'aide de sondes spécifiques. C'est donc une méthode plus fiable. Mais, cela nécessite une grande quantité d'ADN. Par conséquent, la principale différence entre RAPD et RFLP est la procédure et l'importance.

Les références:

1. "ADN polymorphe amplifié aléatoirement (RAPD)". Centre national d'information sur la biotechnologie, Bibliothèque nationale de médecine des États-Unis, disponible ici.2. « Polymorphisme de longueur de fragment de restriction (RFLP). » Centre national d'information sur la biotechnologie, Bibliothèque nationale de médecine des États-Unis, disponible ici.

Image de courtoisie:

1. "RAPD" de Llull ~ commonswiki supposé - Propre travail supposé (domaine public) via Commons Wikimedia 2. "RFLP-figure" de Kenneth.jh.han - Propre travail (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia