Les différence principale entre la protéomique et la transcriptomique est que le la protéomique est l'étude de l'ensemble des protéines produites par un organisme particulier, tandis que la transcriptomique est l'étude de l'ensemble des ARNm synthétisés par un organisme particulier.

La protéomique et la transcriptomique sont deux domaines dans lesquels l'expression génique d'un organisme particulier est étudiée.

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Qu'est-ce que la protéomique

La protéomique est l'étude à grande échelle des protéomes. Le protéome fait référence à l'ensemble des protéines produites par un organisme particulier ou une cellule. Par conséquent, un type particulier d'organisme ou de cellule a un protéome unique. Les principaux domaines d'investigation de la protéomique sont les suivants.

Plusieurs technologies à haut débit telles que la spectroscopie de masse et la différence d'électrophorèse sur gel (DIGE) sont impliquées dans les études protéomiques.

Qu'est-ce que la transcriptomique

La transcriptomique est l'étude du transcriptome d'un organisme ou d'une cellule particulière. Le transcriptome fait référence à l'ensemble complet d'ARNm dans l'organisme ou la cellule. Cependant, il se réfère parfois aussi à l'ensemble de l'ARN. Le transcriptome varie en fonction des conditions environnementales auxquelles l'organisme ou la cellule doit faire face. Par conséquent, il reflète l'ensemble d'ARN exprimé à un moment défini dans un ensemble donné de conditions. La transcriptomique comprend l'étude à la fois du profilage de l'expression et de l'analyse des variantes de tranche. Les puces à ADN et l'ARN Seq sont les deux principales technologies utilisées en transcriptomique.

Figure 2: Microarray et RNA Seq

Similitudes entre la protéomique et la transcriptomique

Différence entre la protéomique et la transcriptomique

Définition

La protéomique fait référence à l'étude des protéomes et de leurs fonctions tandis que la transcriptomique fait référence à l'étude des transcriptomes et de leurs fonctions.

Type d'étude

La protéomique étudie l'ensemble des protéines exprimées tandis que la transcriptomique étudie l'ensemble des ARNm exprimés dans un organisme particulier.

Phénomènes

La protéomique étudie la structure et la fonction 3D des protéines, et les interactions protéine-protéine tandis que la transcriptomique étudie la structure des séquences, les interactions avec l'environnement et les applications de l'ARNm.

Technique

La protéomique implique la spectroscopie de masse et l'électrophorèse sur gel de différence (DIGE), tandis que la transcriptomique implique les puces à ADN et l'ARN Seq comme techniques.

Zones importantes

Certains des domaines importants de la protéomique sont les développements de bases de données de protéomes tels que SWISS-2DPAGE et le développement de logiciels pour la conception de médicaments assistée par ordinateur, tandis que la transcriptomique implique l'étude de la différenciation cellulaire, de la cancérogenèse, des mécanismes moléculaires et des voies de signalisation, qui contrôlent le développement embryonnaire précoce, comme biomarqueurs pour l'évaluation des risques des médicaments ou des produits chimiques, et déduire des relations phylogénétiques entre les individus.

Conclusion

La protéomique est l'étude de l'ensemble des protéines d'un organisme particulier, tandis que la transcriptomique est l'étude de l'ensemble des ARNm de l'organisme. Par conséquent, la principale différence entre la protéomique et la transcriptomique réside dans le type d'étude.

Référence:

1. « Qu'est-ce que la protéomique ? » Proteomics: An Introduction to EMBL-EBI Resources, 8 juin 2016, disponible ici2. Lowe, Rohan et al. « Technologies transcriptomiques ». PLoS Computational Biology 13.5 (2017): e1005457. PMC. La toile. 10 juillet 2018, disponible ici

Image de courtoisie:

1. «Exemples de structure protéique» Par Axel Griewel - Travail personnel (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia2. « Microarray et cellule de flux de séquençage » par Thomas Shafee - Travail personnel (CC BY 4.0) via Commons Wikimedia